Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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