Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms