Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FANCFQ9NPI8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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