Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDFQ9HBH1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms