Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms