Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM8Q9BZR9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms