Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms