Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSF3RQ99062 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms