Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms