Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SERAC1Q96JX3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERAC1Q96JX3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms