Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SMIM12Q96EX1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms