Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms