Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EDAQ92838 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms