Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms