Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3AQ92484 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms