Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms