Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLGALT1Q8NBJ5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms