Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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