Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00299Q6ZSB3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms