Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms