Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZBED9Q6R2W3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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