Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms