Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A4Q6AI14 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms