Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms