Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms