Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.7 ms