Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFKFB3Q16875 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFKFB3Q16875 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFKFB3Q16875 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFKFB3Q16875 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFKFB3Q16875 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFKFB3Q16875 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFKFB3Q16875 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFKFB3Q16875 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PFKFB3Q16875 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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