Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms