Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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