Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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