Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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GABRA6Q16445 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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GABRA6Q16445 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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GABRA6Q16445 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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GABRA6Q16445 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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GABRA6Q16445 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRA6Q16445 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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GABRA6Q16445 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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GABRA6Q16445 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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GABRA6Q16445 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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