Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSX1Q16384 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SSX1Q16384 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SSX1Q16384 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SSX1Q16384 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SSX1Q16384 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SSX1Q16384 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SSX1Q16384 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SSX1Q16384 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSX1Q16384 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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