Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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