Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms