Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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