Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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KCNB1Q14721 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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KCNB1Q14721 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNB1Q14721 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNB1Q14721 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNB1Q14721 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNB1Q14721 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNB1Q14721 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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KCNB1Q14721 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNB1Q14721 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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