Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ATP1A4Q13733 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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ATP1A4Q13733 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1A4Q13733 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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