Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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HTR4Q13639 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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HTR4Q13639 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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