Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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