Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CUL4AQ13619 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CUL4AQ13619 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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CUL4AQ13619 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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