Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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