Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPRL3Q12980 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms