Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PTP4A2Q12974 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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