Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAAP100Q0VG06 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAAP100Q0VG06 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms