Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms