Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms