Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms