Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HK3P52790 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HK3P52790 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HK3P52790 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HK3P52790 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HK3P52790 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HK3P52790 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HK3P52790 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HK3P52790 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HK3P52790 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HK3P52790 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HK3P52790 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HK3P52790 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms