Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP5P51878 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP5P51878 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP5P51878 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP5P51878 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP5P51878 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP5P51878 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP5P51878 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms