Protein–RNA interactions for Protein: P50452

SERPINB8, Serpin B8, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB8P50452 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERPINB8P50452 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms